ФСС требуется для вывоза пиломатериалов, изделий из необработанного дерева, свежих овощей, ягод, фруктов, бобовых, срезанных растений и композиций из них, орехов, семян, зерновых культур и саженцев. Обработка продукции, исключающая присутствие болезнетворных организмов (например, свежезамороженные или консервированные продукты), а также растительное масло, освобождает от необходимости получения сертификата.
Каждая партия экспортируемого груза, включая вагон, судно или автомобиль, требует оформления сертификата. За это отвечает Россельхознадзор и соответствующие органы в регионах. Без фитосанитарного сертификата таможня не пропустит груз.
Фитосанитарный сертификат выдается в двух экземплярах: оригинал и заверенная копия. Копия направляется в таможенные органы Российской Федерации, а оригинал сопровождает груз. Основаниями для отказа в выдаче сертификата могут стать нарушения в процессе заготовки, хранения или транспортировки подкарантинной продукции.